El Consejo Comunitario Mayor de la Asociación Campesina Integral del Atrato tiene como máxima autoridad la Asamblea General, de esta dependen directamente la Junta Directiva y el Comité Disciplinario, quienes cuentan para la toma de sus decisiones con un grupo de asesores Jurídicos y Técnicos multidisciplinarios quienes además de orientar a la Junta Directiva y el Comité Disciplinario, Elaboran y orientan proyectos que redunden en el beneficio de la comunidad.